16 天父上帝：预定、创造和护理
清教徒的所有神学都以一种赞美的眼光看待上帝。他们认为，永活上帝一无所缺，而且祂本身是全然自足的。福音的一切美善正是从上帝的丰盛中流淌而出。理查德·薛伯斯写道：
在世界存在之前，圣父、圣子和圣灵本身就十分幸福，彼此享受。若非上帝乐于传达和传扬祂的美善，就不会有创造或救赎。上帝使用祂的受造物，并非因为能力不足，仿佛没有它们祂就无能为力，而是为了传扬祂的美善。……上帝的美善就像喷泉涌水，或像乳房乐意产出乳汁一样。
换言之，在一切事物的背后，清教徒看到了一位有丰盛慈爱的荣耀上帝：圣父、圣子和圣灵相互活在永恒的爱与相交中。上帝不需要创造世界来满足祂的需要，或是以此成就祂自己。这位上帝的神圣威严不依赖于世界或祂以外的任何事物。
上帝的主权计划
但是，天父如此享受与祂儿子的相交，以致祂对祂的爱满溢出来，并命定永生的儿子要在许多儿子中作长子。正如使徒保罗在《罗马书》8章29节所说：“因为祂预先所知道的人，就预先定下效法祂儿子的模样，使祂儿子在许多弟兄中作长子”。（另见弗1:3-5）因着祂的恩典，藉着基督，不过是受造之物的我们，将凭借“天父的美名”认识、呼求并荣耀上帝。
因此，清教徒认为宇宙的历史和运作——无论是创造还是救赎——都不是建立在摇动或变化的基础或条件上的。上帝是作者。创造的存在和历史以及救赎计划的展开，都直接建立在上帝不变而完美的旨意之上。
清教徒和他们之前的改教者一样，根据《罗马书》9-11章，认同上帝的永恒计划包括预定论，它含有两个方面：（1）天父在永恒的过去和未来拣选那些祂在基督里定意要爱的人，使他们得永生，这不在于他们，而唯独出于天父自己的主权和白白的恩典；（2）天父在永恒的过去和未来弃绝那些祂定意放弃的人，任由他们在祂的主权和公义的忿怒之下，在自己的罪孽中永远灭亡。对于清教徒来说，预定论的惊奇之处不在于一些罪人要永远灭亡，因为那是我们所有人当受的，而在于上帝会以祂奇异的爱和恩典拯救任何罪人。
对于清教徒来说，拣选的教义是罪人的良友。如果没有上帝的拣选，就没有得救的指望。伊恩·默里（IainMurray）说：“拣选的教义对清教徒至关重要。他们和赞奇乌斯（Jerome Zanchius）一样相信，这是‘贯穿整个基督教体系的金线’，他们断言，背离这一真理将使有形教会置于上帝的审判和忿怒之下。”对于清教徒来说，预定论不仅仅是正统的神学，它对福音和敬虔生活都至关重要。
上帝以主权创造
天父出于自己神性的丰盛，按照自己主权的目的，命令创造万物。因此，《启示录》4章11节中向祂高呼：“我们的主，我们的上帝，你是配得荣耀、尊贵、权柄的，因为你创造了万物，并且万物是因你的旨意被创造而有的。”而且，照着祂永恒的旨意，万物都是藉着祂，也是为着祂造的（西1：15-16）。上帝创造美好的万物，也都是照着祂的品格造的。罪和邪恶的感染来自外部，而不是上帝创造的原始部分。
因为清教徒十分重视这个创造的教义，所以他们拒绝有关生命的圣俗二分法。对于他们来说，没有必要退到修道院。正如乔治·斯温诺克（George Swinnock）所说，基督徒应该视“他的店铺和教堂一样是圣地”。
上帝以主权统管
所有这些教义都与清教徒的日常生活密切相关，因为他们还确信上帝所计划和创造的一切，祂必保存、维持和统治。没有什么在祂的关怀和旨意之外。因此，祂引导祂所创造的，托住和统管万有，使它们相互效力成就祂荣耀的目的。
重要的是，上帝对创造的护理和统治延伸到祂所有的被造，包括他们的一切行为以及他们今生所遭遇的一切。对于遭受巨大试炼的清教徒来说，这一真理尤其显明是他们的安慰和支持。以清教徒经典著作《护理之谜》（The Mystery of Providence）的作者约翰·弗拉维尔为例。弗拉维尔因其事工多年遭受政府迫害，且不得不忍受儿子的夭折，以及三任妻子的相继去世。在这一切之中，上帝带有护理的统治和爱是他安慰的支柱。尤其因他知道，对于信徒来说，严酷的护理不再是上帝实施审判的标志，而是父亲般关爱的标志，出于天父对所收养儿女所定的旨意。
这意味着弗拉维尔能够在磨难中感受到深深的安慰和盼望，正如他在这首小诗中所表达的那样：
倘若撒旦能预见到问题和结果，
牠就不会再诱惑了。
圣徒若能看到苦难带来的果实，
他们就会在苦难中欢呼歌唱。
神圣的智慧啊，谁能不钦佩！
看你竟用火救人于火海！
毫无疑问，圣徒们在荣耀里惊叹而立
这些手段如此奇秒，怎能理解。